在膜运行过程中的一个重要问题是膜污染，表现为膜组件运行一定时间后，膜通量下降的现象。管式膜的清洗简单容易，清洗周期长( 1-3个月)，在pH值范围1-13、温度低于40℃的条件下都可以进行膜清洗。清洗时将药剂在膜管内循环3小时左右(总时间)，根据通量变化，1-3个月清洗一次，如果水质较好，清洗周期可达6个月以上。